RESUMO Nas regiões tropicais e subtropicais do mundo todo, as enfermidades podem ser fatores limitantes importantes para a produção do café (Coffea arabica), que possui grande valor no mercado internacional. O objetivo do presente trabalho foi identificar as espécies de Colletotrichum spp. e de outros fungos associados a queda dos dos frutos do café (QFC) e a antracnose dos ramos que podem reduzir a produtividade. Foram utilizados análises filogenéticas, de locos ApMat e GS. Foi identificado Colletotrichum siamense nos frutos verdes e maduros sintomáticos infestados ou não pela broca do café (BFC) como também nos ramos com sintomas de antracnose onde se isolou Colletotrichum alienum. Associados a outras espécies de Colletotrichum, foi isolado do fungo Fusarium incarnatum (= Fusarium semitectum e Fusarium solani), identificados com a combinação TEF e RPB2. Mediante a amplificação de regiões genéticas (ITS, TEF1, CAL, TUB2), foi possível identificar outro fungo nos ramos com antracnose: Diaporthe pseudomangiferae. Este é o primeiro relato da ocorrência de Colletotrichum siamense e Colletotrichum alienum, junto com os fungos Fusarium solani e Diaporthe pseudomangiferae, associados com os frutos de Coffea arabica no estado de Mérida, Venezuela.
ABSTRACT In tropical and subtropical regions worldwide, diseases can be major limiting factors to coffee (Coffea arabica) production, a highly valued crop internationally. Our aim was to identify Colletotrichum spp. and other fungal species associated with Coffee Berry Disease (CBD) and anthracnose on coffee twigs, which can greatly inhibit crop production. Concatenated phylogenetic analyses of ApMat and GS loci were used to identify two Colletotrichum species. Colletotrichum siamense was isolated from symptomatic mature and green berries that were both infested and uninfected with Coffee Berry Borer (CBB) and from twigs displaying anthracnose symptoms. Colletrotrichum alienum was isolated from twigs showing anthracnose symptoms. Along with these two Colletotrichum species, association of Fusarium incarnatum (= Fusarium semitectum) and Fusarium solani was found. Identification of Fusarium species was obtained through combined datasets of partial TEF1 and RPB2. Fusarium isolates came from ripe coffee fruits displaying symptoms of CBD, infested or not with CBB, and coffee twigs. In addition, concatenation of four gene regions (ITS, TEF1, CAL, TUB2) allowed the identification of another fungus, together with isolates from coffee twigs with anthracnose, Diaporthe pseudomangiferae. This is the first report of Colletotrichum siamense and Colletotrichum alienum, along with the fungi Fusarium solani and Diaporthe pseudomangiferae, associated with berry diseases on Coffea arabica in the state of Mérida, Venezuela.
RESUMEN En las regiones tropicales y subtropicales de todo el mundo, las enfermedades pueden ser factores limitantes importantes para la producción de café (Coffea arabica), un cultivo muy valorado a nivel internacional. Nuestro objetivo era identificar Colletotrichum spp., y otras especies de hongos asociadas con la enfermedad de las Bayas o Cerezas del café (CBD) y de la antracnosis en las ramitas de café, que pueden inhibir en gran medida la producción de cultivos. Se utilizaron análisis filogenéticos, concatenando los locus ApMat y GS para identificar dos especies de Colletotrichum. Se aisló Colletotrichum siamense desde bayas verdes y maduras sintomáticas que estaban infestadas y no por Broca del fruto del cafeto (CBB) y desde ramitas que presentaban síntomas de antracnosis. Colletrotrichum alienum se aisló de ramitas que mostraban síntomas de antracnosis. Junto con estas dos especies de Colletotrichum, se encontraron asociados Fusarium incarnatum (= Fusarium semitectum) y Fusarium solani. La identificación de la especie Fusarium se realizaron utilizando conjuntos de datos combinados del parcial TEF1 y RPB2. Los aislamientos de Fusarium provinieron de frutos de café maduros que mostraban síntomas de CBD, infestados o no con CBB y ramitas de café. Asimismo, mediante la concatenación de cuatro regiones genéticas (ITS, TEF1, CAL, TUB2) se identificó otro hongo junto con aislamientos de ramitas de café con antracnosis, Diaporthe pseudomangiferae. Este es el primer reporte de Colletotrichum siamense y Colletotrichum alienum, junto con los hongos Fusarium solani y Diaporthe pseudomangiferae, asociados con enfermedades de las bayas en Coffea arabica en el estado de Mérida, Venezuela.